martes, 17 de marzo de 2015

Extracción de ADN genómico de banana



Práctica extracción de ADN

Para cada grupo

Materiales:
- 10 ml de agua destilada
- 1/8 banana madura (muestra para extraer ADN)
- 1 mortero y su mano
- 2 vasos de pptdo. 100 mL
- Solución SDS 10 %
- 10 ml de Etanol absoluto en hielo o congelado previamente
- Solución NaCl 0,4 M
- 1 probeta de 100 mL
- 1 Varilla de vidrio
- 1 tubo de ensayo
- 2 pipetas de 5 ó 10 mL
- 1 propipeta.
- 1 embudo.
- 1 malla de nylon


Protocolo experimental. Trabajar todo en frio (c/hielo)

En uno de los vasos de precipitado, preparamos 10 ml de solución SDS 2%  NaCl 0,4 M. Reservamos la solución.
En el mortero colocamos el octavo de banana y 10 mL de H2O dest. Pisamos con el almirez hasta formar una pasta homogenea.
Agregamos la pasta formada a la solución de detergente y sal, mezclamos sin levantar espuma. Dejamos actuar 10 minutos.
Filtramos a través de la  malla de nylon.
Tomamos 5 mL del filtrado y lo colocamos en un tubo de ensayo enfriado en hielo.
 Con una pipeta volcamos por las paredes del tubo de ensayo el etanol frio hasta que se forme una interfase turbia. Dejamos reposar 5 minutos en frio.
 Sumergimos la varilla de vidrio en la zona turbia y giramos lentamente para enrollar el ADN a la varilla.

jueves, 23 de diciembre de 2010

Regulación Genética en Procariontes


http://www.ugr.es/~eianez/Microbiologia/15regulacion.htm

https://ocw.unican.es/pluginfile.php/879/course/section/967/Tema%25208-Bloque%2520I-Regulacion%2520Genetica.pdf

miércoles, 17 de marzo de 2010

Protocolo preparación gel de agarosa

Protocolo preparación gel de agarosa.

Preparar cuba de electroforesis y cuna del gel.

A los extremos abiertos de la cuna cubrirlos con cinta de enmascarar 3M Rocket, cuidando de un trozo a lo largo de la cinta sobresalga de la base de la cuna (0,5 cm). Frotar la base y el costado de la cuna en contacto con la cinta para asegurar que toda la superficie este pegada.

Colocar el peine en la parte superior de la cuna.

Colocar la cuna así preparada dentro de la cuba.

Preparación de la agarosa.

Pesar agarosa suficiente para un volumen de 150 mL y una concentración de 0,8 %. (unos 1,2 g).

Colocar la agarosa en un erle de 250 mL, agregar los 150 mL de buffer de corrida 1X (TBE), marcar hasta donde llega el buffer.

Llevar al microondas y fundir la agarosa. Controlar el nivel de líquido, si está por debajo de la marca realizada, completar hasta allí con H2O demonizada.

Dejar enfriar. Agregar antes de volcar 75 uL de Bromuro de etidio, agitar suavemente para mezclar. A partir de aquí la manipulación del gel debe hacerse con guantes, ya que el BrEt es mutagénico.

Volcar dentro de la cuna y dejar gelificar.

Una vez gelificado, sacar con cuidado las cintas de los bordes.

Llenar la cuba con el buffer de corrida 1X, colocar allí la cuna con el gel, recién entonces con cuidado sacarle el peine.

martes, 24 de junio de 2008

Protocolo de extraccion de DNA

PROTOCOLO MINI PREP
METODO ALCALINO
BIRNBOIM-DOLY.



Para cada grupo.

Se centrifugan 1,6 mL de cultivo de E.coli 5’ a 4ºC 10000 RPM.
Se descarta el sobrenadante.
(esta parte no la vamos a hacer, van a estar los pellets directamente)

Al pellet bacteriano se lo resuspende en 100 uL de solución de lisis c/lisozima. Se deja incubar 15’.

Se le agrega 200 uL de solución alcalina se mezcla bien y se deja incubar en hielo 5’.

Se agrega 150 uL de acetato de sodio 3 M pH:4,8/5,2. Se agita hasta aparición de un flóculo blacuzco, se coloca en hielo y se deja 30’.

Se centrifuga 15’ a 10000 RPM 4ºC.

En otro eppendorf rotulado se coloca 1 mL de EtOH absoluto en frio.
El sobrenadante de la centrifugación se mezcla con el alcohol y se deja 2’.

Se lleva a centrifugar 15’ a 10000 RPM 4ºC.

Se descarta el sobrenadante, y se lava el pellet con alcohol 70%.

Se deja secar a T. Amb. o en estufa de 37ºC.

Se resuspende con 50 uL de agua o TE pH:8.0.

miércoles, 28 de mayo de 2008

modificaciones post traduccionales

http://ftp.utalca.cl/profesores/raherrera/biorom2008/contenido/av_bma/apuntes/T16/modCov.htm

https://prezi.com/pnolkf-ebz9u/modificaciones-post-traduccionales/

http://www.fao.org/docrep/007/y5468s/y5468s05.htm#TopOfPage

Antibioticos